MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 12464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016928	ATT	2	6	151	156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016928	AC	4	8	174	181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016928	AC	3	6	260	265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016928	TG	3	6	333	338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016928	GTC	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016928	ATTT	2	8	370	377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016928	TAA	2	6	410	415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016928	TTA	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016928	ATT	2	6	458	463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016928	GT	3	6	470	475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016928	AAGA	2	8	523	530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016928	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016928	TAA	3	9	1946	1954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016928	T	6	6	1961	1966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016928	AC	3	6	2033	2038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016928	CCA	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016928	CTA	3	9	2114	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016928	TA	3	6	2142	2147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016928	TA	4	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016928	ATAAAT	2	12	3318	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016928	ATTA	2	8	3343	3350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016928	T	6	6	3366	3371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016928	GAAAA	2	10	3374	3383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016928	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016928	AATA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016928	CCAA	2	8	3469	3476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016928	AAT	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016928	GAG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016928	TAG	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016928	AAGG	2	8	4059	4066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016928	ACC	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016928	GGT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016928	AAT	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016928	TA	3	6	4137	4142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016928	AAAT	2	8	4143	4150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016928	TAA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016928	TTTAAA	2	12	4238	4249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016928	A	6	6	4306	4311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016928	A	6	6	4332	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016928	AATT	2	8	4342	4349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016928	A	7	7	4398	4404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016928	AT	3	6	4411	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016928	ATT	2	6	4442	4447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016928	TGAAC	2	10	7744	7753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016928	AGG	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016928	A	7	7	10436	10442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016928	AT	3	6	11388	11393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016928	TAT	2	6	11413	11418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016928	ATT	3	9	11433	11441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016928	ATT	2	6	11499	11504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016928	ACA	2	6	11515	11520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016928	ATA	2	6	11558	11563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016928	AAG	2	6	11618	11623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016928	TAA	2	6	13244	13249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016928	AT	3	6	13272	13277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016928	AG	3	6	13291	13296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016928	AT	4	8	13325	13332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016928	CTAC	2	8	13337	13344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016928	T	7	7	13475	13481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016928	A	6	6	13489	13494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016928	ATA	2	6	13514	13519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016928	ATT	2	6	13527	13532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016928	TA	3	6	14865	14870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016928	ATA	2	6	14907	14912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016928	GTG	2	6	14922	14927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016928	T	7	7	14944	14950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016928	AAC	2	6	14986	14991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016928	CAA	2	6	15039	15044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016928	ATG	2	6	15057	15062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016928	ATAA	2	8	15121	15128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016928	GTA	2	6	15143	15148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016928	GTAGG	2	10	15166	15175	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016928	G	6	6	15174	15179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016928	ATG	2	6	15180	15185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016928	TCA	2	6	15223	15228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016928	A	6	6	15237	15242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016928	AAC	2	6	15263	15268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016928	TAAA	2	8	15300	15307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016928	A	6	6	15305	15310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016928	GTAT	2	8	15362	15369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016928	TGT	2	6	15394	15399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016928	TAT	2	6	15433	15438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016928	T	6	6	15438	15443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016928	TA	3	6	15450	15455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016928	AGG	2	6	15471	15476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016928	AAC	2	6	16645	16650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016928	TCA	2	6	16672	16677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016928	CTT	2	6	16816	16821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016928	T	7	7	16843	16849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016928	AGG	2	6	16855	16860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016928	TA	3	6	17843	17848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016928	TAAATC	2	12	17927	17938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016928	AAT	2	6	17966	17971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016928	CA	3	6	17989	17994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016928	TTA	2	6	18040	18045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016928	ATA	2	6	18109	18114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016928	AAT	3	9	22943	22951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016928	AT	3	6	22998	23003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016928	TGA	2	6	23025	23030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016928	TA	3	6	24493	24498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016928	AGG	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016928	TCGAT	2	10	24576	24585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016928	GGT	2	6	24613	24618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016928	GAT	2	6	24646	24651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016928	TAA	2	6	24685	24690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016928	ATT	2	6	24778	24783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016928	AATA	2	8	24786	24793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016928	TTC	2	6	24829	24834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016928	A	6	6	24835	24840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016928	A	6	6	24858	24863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016928	ATCT	2	8	24896	24903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016928	CGG	2	6	24954	24959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016928	T	6	6	24992	24997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016928	GCCT	2	8	25024	25031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016928	T	7	7	25100	25106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016928	ATATT	2	10	25114	25123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016928	TTA	2	6	25249	25254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016928	AT	3	6	25264	25269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016928	TTC	2	6	25286	25291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016928	CCA	2	6	25303	25308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016928	TCC	2	6	25310	25315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016928	AAT	2	6	25340	25345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016928	ATTT	2	8	25349	25356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016928	TAT	2	6	25401	25406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016928	TCA	2	6	25420	25425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016928	CCG	2	6	25451	25456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_016928	TAA	2	6	25465	25470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016928	A	6	6	25469	25474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016928	AT	3	6	25480	25485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016928	TA	3	6	25531	25536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016928	T	6	6	25605	25610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016928	A	6	6	25635	25640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016928	ATA	2	6	25648	25653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016928	AAC	2	6	26411	26416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016928	TAA	2	6	30350	30355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016928	TCA	2	6	30371	30376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016928	TAT	2	6	30415	30420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016928	AT	3	6	30458	30463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016928	TAA	2	6	30536	30541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016928	CATT	2	8	30548	30555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016928	ATA	2	6	30610	30615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016928	AG	3	6	30700	30705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016928	CTG	2	6	31556	31561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016928	GAC	2	6	31565	31570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016928	T	6	6	31583	31588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016928	TGT	2	6	31590	31595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016928	TGG	2	6	31596	31601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016928	TGT	2	6	31610	31615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016928	A	6	6	31642	31647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016928	AAT	2	6	31674	31679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016928	ATCA	2	8	31689	31696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016928	ATA	2	6	31716	31721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016928	AT	3	6	34063	34068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016928	TAC	2	6	34078	34083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_016928	T	7	7	34114	34120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016928	A	6	6	34125	34130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016928	TAA	2	6	34174	34179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016928	TAA	2	6	35020	35025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016928	TGA	2	6	35042	35047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016928	AT	3	6	35054	35059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016928	TGA	3	9	35111	35119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_016928	T	7	7	35594	35600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016928	ATTA	2	8	35610	35617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_016928	GA	3	6	36618	36623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_016928	AGA	2	6	37332	37337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_016928	T	6	6	38204	38209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_016928	ATA	2	6	38232	38237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016928	A	6	6	38273	38278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_016928	TGT	2	6	41603	41608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_016928	TTTA	2	8	61228	61235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016928	ATT	2	6	61246	61251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_016928	AAT	2	6	95653	95658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_016928	A	6	6	98004	98009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_016928	TGT	2	6	98027	98032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016928	ATAA	2	8	98040	98047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_016928	ATCA	2	8	98050	98057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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460	NC_016928	ATA	2	6	101030	101035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_016928	A	6	6	101049	101054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_016928	ATAA	2	8	101125	101132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_016928	ATT	2	6	102885	102890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_016928	TTA	2	6	102935	102940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016928	ATG	2	6	102991	102996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_016928	ATT	2	6	108169	108174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_016928	ATAA	2	8	108175	108182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_016928	AT	3	6	108207	108212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_016928	TATT	2	8	108213	108220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_016928	ATC	2	6	108308	108313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_016928	TGT	2	6	109990	109995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_016928	ACC	2	6	110171	110176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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